Был господарем Молдовы с января 1785 по декабрь 1786 года.

Был сыном Иоана Маврокордата. Родом из Фанара. Александр II Маврокордат был последним представителем семьи Маврокордатов на троне Молдовы.

В молодости учился в военной школе Санкт-Петербурга. Прежде чем стать господарем Молдовы, был драгоманом Порты. В этом качестве он участвовал в переговорах и подписал трактат 1783 года, по которому Крым отходил к Российской империи.

Турки назначили Александра II Маврокордата господарем Молдовы в январе 1785 года. Однако, узнав, что он поддерживает дипломатические отношения с Санкт-Петербургским императорским двором, сместили его в декабре 1786 года, невзирая на то, что незадолго до этого Александр II Маврокордат выплатил 800 кошельков для подтверждения своего господарства.

Свергнутый господарь обратился с письмом к русской императрице Екатерине II, прося разрешения на проживание в России. Екатерина II поручила Александру II Маврокордату дождаться ее приезда в Кременчуге, который она намеревалась посетить во время поездки по югу империи.

В начале 1787 года Александр II Маврокордат втайне бежал из Ясс, покинув семью и двор, и направился к Днестру, где его ждал военный отряд русских. В сопровождении 600 гусар господарь отправился в Кременчуг, где в мае 1787 года встретился с Екатериной II. Поскольку он бежал в Россию, современники дали ему прозвище Фирарис (Беглец).

Бегство Александра II Маврокордата настолько разозлило турок, что они арестовали русского посла в Стамбуле И.И. Булгакова, заключив его в тюрьму Семи башен на 812 дней. Порта выдвинула России ультиматум, требуя выдачи Александра II Маврокордата, на который Россия не ответила. Это стало мотивом начала новой русско-турецкой войны (1787 -1791).

Александр II Маврокордат обосновался в Елизаветграде. Получил титул князя Российской империи, а в 1792 году его кандидатура была предложена для управления территориями между Бугом и Днестром так называемой Новой Молдовы, которые отошли к России по Ясскому мирному договору 1791 года.

Александр II Маврокордат умер в 1819 году и похоронен в Свято-Даниловском монастыре Москвы.